注目★★★★★Hacker News
Google DeepMind、全90億変異を読むAlphaGenome Atlas公開
30秒で把握
- 1Google DeepMind が全90億単一塩基変異を予測するAtlas公開
- 2AlphaGenomeで1ペタバイトを事前計算しAVIスコアに統合
- 3UK Biobank 54,000人超で非コード関連を22%多く発見
要約
Google DeepMind は、ヒトゲノムで起こり得る全90億件の単一塩基変異の影響を予測するデータベース「AlphaGenome Atlas」を公開した。AlphaGenomeで各変異の遺伝子制御への影響を事前計算し、1ペタバイトのデータセットにまとめた。コーディング領域と非コード領域の予測を統合したAVIスコアにより、研究者は影響の大きい変異を優先して調べられる。54,000人超のUK Biobankデータでは、非コード領域の遺伝的関連を22%多く発見し、BMIに関連する19の遺伝領域を特定した。コード不要のWebポータルで研究者や生物学者に提供する。
あなたへの影響
ゲノム解析に関わる日本の研究者は、公開ポータルでAVIスコアの検索性と自分の変異データへの適用可能性を近日中に評価するとよい。
推奨:AVIスコアは、コーディング領域と非コード領域の影響予測を統合した指標である。